BROTES - CION - SCION - SION - VÁSTAGOS (WIV04); PROYECTOS nCOV /TARIFAS E INVERSIONES
"Hemos desarrollado Nextstrain para visualizar los brotes lo más cerca posible del tiempo real. Si bien actualmente abarca una selección de virus, próximamente se extenderá a patógenos no virales." 01 December 2018, Este trabajo fue apoyado por el Open Science Prize para TB y RAN, por la NSF a través de DGE-1256082 para SMB, por el ERC a través de StG-260686 para RAN y por NIH R35 GM119774-01 para TB. TB es una becaria biomédica de Pew.
Zika tutorial – fasta input
"hCoV-19/Wuhan/WIV04/2019 (WIV04) es la secuencia de referencia oficial empleada por GISAID (EPI_ISL_402124). Se eligió WIV04 debido a su secuencia genómica de alta calidad y porque representaba el consenso de un puñado de presentaciones iniciales para el betacoronavirus responsable de COVID-19. (Pilailuk et al 2020) WIV04 es representativo e idéntico a las secuencias de los primeros brotes. WIV04 fue aislado por el Instituto de Virología de Wuhan a partir de una muestra clínica de líquido de lavado broncoalveolar (BALF) recolectada en el Hospital Wuhan Jinyintan en la provincia de Hubei el 30 de diciembre de 2019 de un paciente sintomático, un minorista que trabaja en el mercado mayorista de mariscos de Huanan." https://gisaid.org/wiv04/
(WIV04) 28 de mayo de 2021
https://pandemicprepardness.org/wiv04/outside.htmlNucleotide Sequence
Protocol: Real-time RT-PCR assays for the detection of SARS-CoV-2
Institut Pasteur, Paris
"Se ha designado un control específico.
El control positivo para RT-PCR en tiempo real es un ARN transcrito in vitro derivado de una cepa BetaCoV_Wuhan_WIV04_2019 (EPI_ISL_402124). La transcripción contiene las regiones de amplificación del gen RdRp y E como cadena positiva. Cada microtubo contiene 10 11 copias de secuencias diana diluido en ARNt de levadura y liofilizado." https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/real-time-rt-pcr-assays-for-the-detection-of-sars-cov-2-institut-pasteur-paris.pdf?sfvrsn=3662fcb6_2
"El presente ensayo clínico se ha diseñado y llevado a cabo en el Medio Oriente (Emiratos
Árabes Unidos y Baréin) para averiguar, en un año de observación, determinadas variables de
eficacia y seguridad individuales y poblacionales.
OBJETIVO: Evaluar la reducción en la incidencia de casos [leves, moderados o severos] de
COVID-19, que se confirman por RT-PCR tras experimentar síntomas, de 2 dosis estándar de las
dos Vacunas anti-COVID-19 de virus inactivados WIV04 y HB02 frente a una Vacuna de control
con solución de hidróxido de aluminio (que es el adyuvante presente en las vacunas)". http://evalmed.es/wp-content/uploads/2021/06/VN-ECA-Vacunas-Covid-19-Virus-inactivados-WIV04-o-HB02-vs-Control-AlOH3.pdf
enero 2020
"Peng Zhou y sus colegas del Instituto de Virología de Wuhan desarrollaron un nuevo coronavirus (más tarde llamado SARS-CoV-2) en cultivo celular (aislado) a partir de líquido de lavado broncoalveolar recolectado de una paciente enferma y con RT-PCR positiva (UCI- 06 en Spike tree=WIV04/2019 virus). El paciente no desarrolló anticuerpos IgM para Legionella pneumophilia, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, virus respiratorio sincitial, adenovirus, Rickettsia, virus de influenza A, virus de influenza B y virus parainfluenza." https://virologydownunder.com/sigh-yes-the-covid-virus-is-real/
SARS-CoV-2 Inhibitors
888958-25-6 El SARS-CoV-IN-1 es uno de los derivados de la hidroxiferroquina con actividades antipalúdicas y antivirales, y también un inhibidor eficaz de la replicación del SARS-CoV.
888958-26-7 El SARS-CoV-IN-2 es uno de los derivados de la hidroxiferroquina con actividades antipalúdicas y antivirales, y también un inhibidor eficaz de la replicación del SARS-CoV.
"El proyecto ncov se creó el 19 de enero y ahora tiene 20 colaboradores, 239 confirmaciones, 150 estrellas y 29 bifurcaciones. Vale la pena mencionar que hay muchos programadores chinos entre los colaboradores. Además, alguien ya ha traducido el informe al chino."
Coronavirus projects
Auspice: una herramienta interactiva de código abierto para visualizar datos filogenómicos Auspice es un software para mostrar hermosas visualizaciones interactivas de datos filogenómicos.
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